各中心、项目组:
随着基因组学、转录组学、蛋白质组学等“组学”技术的广泛应用,大量数据的存储、处理和分析需要强大的计算能力和高效的数据管理平台。高性能计算平台将大幅缩短数据分析的时间,从而加速科研进展。研究人员能够更快地从数据中提取有价值的信息,推动植物基因功能研究、基因组育种等领域的发展。平台机架式服务器资源有限,请大家积极参加培训,只允许参加培训的人预约和使用,改善运行环境。本次培训将开放学生账户。培训日程如下:
培训时间:2025年9月16日(周二)14:00-17:00
培训地点:科学楼一楼会议室
培训人:信同诚工程师 等
培训内容: 超聚变2258 V7;2U机架式服务器
1、服务器主要配置:
(1) 计算节点:CPU 2*AMD Genoa 9554(3.1GHz/64-Core/256MB);内存 16*64GB,DDR5 RDIMM;硬盘 2*480GB 固态硬盘;RAID卡 XC470C-8i 4G-RAID0,1,5,6,10,50,60-4GB Cache;网卡2*GE+ 2*10GE光口万兆(含光模块)。
(2) 管理节点:CPU 2*AMD Genoa 9334(2.7GHz/32-Core/128MB);内存 4*32GB,DDR5 RDIMM;硬盘 2*1.92TB 固态硬盘+12*16TB 机械硬盘;RAID卡 XC470C-M-16i 4G-RAID0,1,5,6,10,50,60-4GB Cache;网卡 2*GE+2*10GE光口万兆(含光模块)。
(3) Linux操作系统CENT OS 7.9。环境配置:perl、R、awk。提供 HPC 基础软件环境,包含常用 MPI、数学函数库、GPU 开发环境、GNU 编译器,支持 C/C++/Fortran,Intel 编译器,支持C/C++/Fortran,MKL、BLAS、LAPACK、ScaLAPACK、FFTW 等,OpenMP 并行环境,OpenMPI、MVPAICH2 等 MPI 并行环境。
(4) 安装常用的及采购人指定的生信软件的各个版本(包括但不限于getorganelle、NOVOplasty、PGA、minia、seqtk、hmmer、itsx、OrthoMCL、Gene-Miner、BEAST、RAXML、TRINITY、OrthoFinder、Astral-II、java 8、PAML、trimal、Mrbayes、blast、bowtie2、Transdecoder、Trinotate、TMHMM、fastanrdb、SeqKit等)。
2、账号登录,LSF 调度器使用
3、环境激活使用,CMOM 使用
4、《植物所高性能计算集群使用规范》
培训要求:参加培训的老师和同学提前5分钟到达指定培训地点。已申请账号的老师请带电脑现场测试。联系人:印敏(电话:7180)。
科技管理处
2025年9月12日